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Plateformes & équipements |
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Personnes responsables des différentes plateformes et équipements
descriptions détaillées des DIFFÉRENTES PLATEFORMES ET ÉQUIPEMENTS
plateau Animalerie rongeur et poisson zèbre
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Depuis son déménagement sur le site de Saint-Pierre, l'unité a mis en place une animalerie rongeurs et poissons-zèbres qui a été agréée (974-005A) par la Préfecture de La Réunion en juillet 2023 et pour laquelle DéTROI est référencé Établissement Utilisateur (EU0752) auprès de la Cellule AFiS du Ministère et du Comité d’Ethique en Expérimentation Animale de La Réunion (CEEA n°114). Avec un taux élevé de similarité génétique compris entre 70 et 85%, le poisson zèbre offre de nombreux avantages, notamment en ce qui concerne sa reproduction rapide et sa croissance autonome dès le sixième jour de vie. Son petit format et son coût abordable en font un modèle d'étude économique et facile à élever. Sa transparence durant les premiers stades de développement permet aux chercheurs d'observer et d'analyser les processus biologiques sans nécessiter d'interventions invasives. A ce jour, nous disposons de 7 lignées de poissons-zèbres (wild-type + 6 transgéniques) et 11 lignées de souris (C57Bl6/J wild-type + 10 transgéniques). Il s’agit de la seule animalerie/plateforme de ce type sur l'île de La Réunion. Nous souhaitons poursuivre son développement et accroître la visibilité de cette dernière.
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Plateau microbiologie / production de protèines recombinantes
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Le plateau microbiologie / production de protéines recombinantes comprend 3 incubateurs INFORS de grande capacité permettant la culture de bactérie jusqu’à 40L en simultané dans une gamme de température allant de 4 à 40 °C. Avec l’acquisition de deux photo bioréacteurs de 3L, l’Unité est en capacité de produire des protéines recombinantes via des microalgues, appareils qui sont actuellement mis à disposition du laboratoire ChemBioPro. L’unité possède deux appareils de chromatographie liquide FPLC AKTA PURE 25 nous permettant de purifier les protéines recombinantes surexprimées au laboratoire. Ces appareils ultra performants permettent la purification de 5 échantillons différents, sur 5 colonnes différentes de façon automatisée et en série. L’unité possède également un liquéfacteur d’azote ce qui nous rend autonome dans la conservation des lignées cellulaires et des souches bactériennes. De plus, l'attractivité de cet appareil nous permet de mettre en place des prestations permettant de fournir de l’azote liquide aussi bien à des unités universitaires qu’à des prestataires extérieurs.
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Plateau analytique / protéomique / Spectroscopie de masse & Module RMN
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Le plateau de spectrométrie de masse comprend un spectromètre de masse de haute résolution de type orbitrap (Q-Exactive Plus), associé à deux systèmes de chromatographies liquide : une nano chromatographie liquide (nano-LC) et une chromatographie liquide à ultra haute performance (UHPLC), équipée d’un module ultraviolet. Notre expertise unique dans l’île dans les domaines de la métabolomique, de la protéomique et de l’imagerie par spectrométrie de masse a permis à notre unité de collaborer avec de nombreux acteurs de la recherche académique (UMR PIMIT, UMR QualiSud, CHU de la Réunion) et privée (Bio’R, EcoEX, Green mascareigne,,Abionyx). Il est envisagé la mise en place d’une plateforme de services pour assurer l’entretien de ces équipements et justifier de l’acquisition d'un spectromètre de masse supplémentaire, offrant des performances supérieures et complémentaire à celles de l'Orbitrap actuel.
L'unité DéTROI s’est dotée du module IVDr B.I LISA adapté au spectromètre RMN Bruker Avance III 600 MHz, qui nous permet d'analyser différents marqueurs plasmatiques dont les profils lipoprotéiques : quantification de l'Apo-A1, de l'Apo-A2, de l'Apo-B100 et de la taille et de la composition des lipoprotéines : 6 sous-classes de LDL (1-6), 5 sous-classes de VLDL (1-5) et 4 sous-classes de HDL (1,-4). Il permet également la quantification des métabolites dans une approche complémentaire à la spectrométrie de masse : acides aminés et dérivés (acide 2-Aminobutyrique, alanine, asparagine, créatine, créatinine, acide glutamique, glutamine, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, méthionine, N,N-Diméthylglycine, ornithine, phénylalanine, proline, sarcosine, thréonine, tyrosine et valine), acides carboxyliques (acide 2-Hydroxybutyrique, acide acétique, acide citrique, acide formique, acide lactique, acide succinique), choline, cétoacides et dérivés (acide 2-Oxoglutarique, acide 3-Hydroxybutyrique, acide acétoacétique, acétone, acide pyruvique), sucres et dérivés (D-Galactose, glucose, glycérol), diméthylsulfone, éthanol et TMAO.
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Production de nanobodies /technique de phage display
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L’unité possède une banque synthétique de 3 milliards de séquences codant des anticorps recombinants à simple domaine (VHH ou Nanobody) . Cette banque peut être utilisée pour isoler par la technologie de phage display des anticorps de haute affinité et de haute sélectivité contre une infinité de cibles potentielles. Une salle dédiée à la manipulation des bactériophages est entièrement équipée à cet effet. Les anticorps isolés sont produits en bactérie ou en cellules de mammifère sous différents formats monovalents, bivalents ou bispécifiques. Le laboratoire de bactériologie est opérationnel. Ces anticorps recombinants peuvent être fusionnés à différents peptides en vue de leur purification par FPLC (voir ci-dessous) ou de leur fonctionnalisation à des fins de développement d’outils de diagnostic ou thérapeutiques. Les équipements nécessaires à leur caractérisation biochimique déterminant leur sélectivité, leur affinité, leur température de fusion, ou leur capacité à fonctionner dans des kits ELISA sandwich ou HTRF sont en place au laboratoire ( lecteur de plaques spectrofluorimètre avec module HTRF, microcalorimètre ITC).
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